根據媒體報道，《GTA三部曲：終極版》其中包含有授權已經過期的音樂，另外還有包含開發者評論的未編譯代碼。

有玩家在分析三部曲合集的數據文件時發現了這些信息，這也有可能是R星在游戲發售之后又將其下架的一個原因。

PC玩家在游戲發售之后，便由于R星啟動器進入“維護”狀態導致無法正常游戲。有用戶針對三部曲文件進行數據挖掘，發現所有因為授權過期而被刪除的《GTA圣安地列斯》音樂實際上仍然存在于游戲文件之中，游戲只是不對其進行播放而已。

用戶在推特上表示：“終極版選擇的音樂格式是OGG-VORBIS，《GTA圣安地列斯》包含所有被砍掉的音樂，只是在腳本中禁止播放。”

還有用戶對《GTA罪惡都市》進行類似查找，同樣發現了游戲中被禁止播放的比如邁克爾·杰克遜的音樂。

還有數據挖掘人員發現，游戲代碼中包含未編譯版main.scm文件，其中包含《GTA 3》、《GTA罪惡都市》和《GTA圣安地列斯》所有的游戲腳本。挖掘人員表示，未編譯版本堪稱對游戲幕后人員感興趣的玩家的“圣杯”，因為里面包含被刪除的缺失內容，還有當年R星北方工作室員工的信息。